По версии следствия, Сергей Будагов вступил в преступный сговор с группой чиновников. В период с апреля 2009 по декабрь 2010 года они организовали приобретение 99% акций ОАО «АПК «Орловская Нива» по искусственно заниженной стоимости. Эти акции принадлежали департаменту имущества, промышленности и информатизации Орловской области.
Предварительный размер причиненного государству ущерба оценивается не менее чем в 425 миллионов рублей. На данный момент следователям не удалось установить конкретных чиновников, причастных к этому преступному сговору.

